2004年度数理和地学领域教育部重点实验室评估结果，以北京大学为依托单位的3个重点实验室被评为优秀类实验室，分别是：数学与应用数学教育部重点实验室（数学学院）、重离子物理教育部重点实验室（物理学院）、地表过程分析与模拟教育部重点实验室（环境学院）。

2004年度全国共有26个数理和地学领域的教育部重点实验室参加了由教育部组织的评估。经过专家组现场评估和综合评估两个阶段的考察，最后评出5个优秀类实验室，19个良好类实验室和2个较差类实验室。

重点实验室是高等学校组织高水平科学研究、聚集和培养优秀人才、开展学术交流的重要基地。北京大学现有1个国家实验室（联合）、12个国家重点实验室（其中4个联合）、13个教育部重点实验室（其中3个在建设中）、6个卫生部开放实验室和2个北京市重点实验室，是我校最重要的人才基地和科研成果产出基地。