大会于19日上午9时开幕，北京大学常务副校长林建华、国家自然科学基金委员会地球科学部常务副主任柴育成、中国地质调查局常务副局长张洪涛等领导、及会议指导委员会主任李廷栋院士出席开幕式并发表了重要讲话。领导讲话强调了青藏高原在地球科学领域的独特性和优势性，总结了青藏高原地球科学研究所面临的机遇与挑战，强调了地球系统科学为指导的战略思想，并对会议提出了希望。

本次会议的宗旨是：分析青藏高原地球科学研究的机遇与挑战，探讨青藏高原地球科学研究将来的发展方向，提出切实可行而又可能突破的研究重点，为相关部门下阶段决策提供参考。为实现这个会议目标，两天的研讨会正式日程分为5个时段，每个时段进行一个科学专题的研讨。五个专题分别是：

专题一）壳幔三维结构与现代变形过程：从层析到实时监测；

专题二）青藏高原及邻区综合：从模拟到模型；

专题三）沉积盆地动力学：环境与隆升过程的地质记录与资源；

专题四）陆―陆碰撞过程及大陆动力学；

专题五）深部过程反演：壳幔物质相互作用与成矿。

每个专题研讨又分为两个时间大致相等的部分，前一部分为主题发言，由所设专题领域国内外最优秀科学家，从学科领域角度出发，较全面总结了本领域内国内外的研究进展，提出了尚且存在的问题，并指出了本研究领域将来可能的研究重点和研究方向。后一部分为自由讨论，由与会科学家就研究重点和研究方向展开热烈的讨论，各位专家都以发展青藏高原地球科学为己任，无私地在会议上展现自己的成果，并充分发挥各自的优势，畅所欲言，为青藏高原地球科学的发展献计献策。通过主题发言和热烈研讨，会议在各个专题领域都达成了比较一致的意见，基本上为青藏高原地球科学研究的下一步发展形成了一个雏形建议。根据这样的会议进展，会议指导委员会和会议工作组，在会议期间召开了有国家自然科学基金委员会地球科学部和中国地质调查局有关领导参加的联席会议，制定了编写《青藏高原地球科学研究的机遇与挑战》计划，并制定了具体工作安排。