会议由张礼和院士主持，教育部科技司明炬处长、国家自然科学基金委化学部梁文平副主任及北京大学医学部副主任方伟岗教授先后发表讲话，对天然药物及仿生药物国家重点实验室的发展提出了希望和建议，即借助“重大新药创制”国家科技重大专项正式启动这一契机，凝练实验室重点研究方向，力争在基础研究与应用研究方面有一个新的提高；集中资源，提升科技创新能力，将实验室发展成为一流的新药研发基地；加快人才和学术力量引进, 构建新药研发的先进团队；加大对外交流与合作，提高在国内外相关领域以及同行间的影响力。

重点实验室主任叶新山教授向学术委员会作了2008年工作报告，从科学研究、队伍建设、对外开放与学术交流、平台建设以及今后的发展思路等方面进行了汇报。会议特别邀请郝小江教授、李学军教授、周德敏教授和吕万良教授先后做了学术报告。

最后学术委员们针对实验室一年来的科研工作进行了热烈的讨论，分析了目前存在的问题，对今后发展方向给出了中肯的建议。并对2008年度实验室自主课题(29项)和对外开放课题(15项)申请书进行了评审。